Protein–RNA interactions for Protein: Q6V4S5

Sdk2, Protein sidekick-2, mousemouse

Predictions only

Length 2,176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdk2Q6V4S5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdk2Q6V4S5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdk2Q6V4S5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdk2Q6V4S5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdk2Q6V4S5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdk2Q6V4S5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdk2Q6V4S5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdk2Q6V4S5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdk2Q6V4S5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sdk2Q6V4S5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Sdk2Q6V4S5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Sdk2Q6V4S5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Sdk2Q6V4S5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Sdk2Q6V4S5 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdk2Q6V4S5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Sdk2Q6V4S5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdk2Q6V4S5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Sdk2Q6V4S5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdk2Q6V4S5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdk2Q6V4S5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdk2Q6V4S5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdk2Q6V4S5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms