Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HjurpQ6PG16 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms