Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtifQ6PEE2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms