Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms