Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Fndc3bQ6NWW9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Fndc3bQ6NWW9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Fndc3bQ6NWW9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc3bQ6NWW9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc3bQ6NWW9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc3bQ6NWW9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc3bQ6NWW9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc3bQ6NWW9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc3bQ6NWW9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc3bQ6NWW9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc3bQ6NWW9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc3bQ6NWW9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc3bQ6NWW9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc3bQ6NWW9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc3bQ6NWW9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc3bQ6NWW9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc3bQ6NWW9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc3bQ6NWW9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc3bQ6NWW9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc3bQ6NWW9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc3bQ6NWW9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc3bQ6NWW9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc3bQ6NWW9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc3bQ6NWW9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc3bQ6NWW9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc3bQ6NWW9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc3bQ6NWW9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc3bQ6NWW9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc3bQ6NWW9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms