Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms