Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms