Protein–RNA interactions for Protein: Q64704

Stx3, Syntaxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx3Q64704 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx3Q64704 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx3Q64704 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms