Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms