Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms