Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SspnQ62147 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SspnQ62147 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SspnQ62147 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SspnQ62147 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SspnQ62147 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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