Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Foxd3Q61060 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Foxd3Q61060 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Foxd3Q61060 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Foxd3Q61060 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd3Q61060 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd3Q61060 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd3Q61060 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd3Q61060 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd3Q61060 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd3Q61060 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd3Q61060 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd3Q61060 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd3Q61060 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd3Q61060 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd3Q61060 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd3Q61060 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd3Q61060 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd3Q61060 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd3Q61060 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd3Q61060 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd3Q61060 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd3Q61060 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd3Q61060 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd3Q61060 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Foxd3Q61060 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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