Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms