Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms