Protein–RNA interactions for Protein: Q60769

Tnfaip3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip3Q60769 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfaip3Q60769 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms