Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms