Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms