Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVR0

Tbc1d9b, TBC1 domain family member 9B, mousemouse

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Length 1,263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d9bQ5SVR0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Tbc1d9bQ5SVR0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tbc1d9bQ5SVR0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tbc1d9bQ5SVR0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tbc1d9bQ5SVR0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Tbc1d9bQ5SVR0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tbc1d9bQ5SVR0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tbc1d9bQ5SVR0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tbc1d9bQ5SVR0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Tbc1d9bQ5SVR0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Tbc1d9bQ5SVR0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Tbc1d9bQ5SVR0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tbc1d9bQ5SVR0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tbc1d9bQ5SVR0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tbc1d9bQ5SVR0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tbc1d9bQ5SVR0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Tbc1d9bQ5SVR0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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Tbc1d9bQ5SVR0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Tbc1d9bQ5SVR0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Tbc1d9bQ5SVR0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tbc1d9bQ5SVR0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tbc1d9bQ5SVR0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tbc1d9bQ5SVR0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tbc1d9bQ5SVR0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tbc1d9bQ5SVR0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tbc1d9bQ5SVR0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tbc1d9bQ5SVR0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tbc1d9bQ5SVR0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tbc1d9bQ5SVR0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tbc1d9bQ5SVR0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tbc1d9bQ5SVR0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Tbc1d9bQ5SVR0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tbc1d9bQ5SVR0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tbc1d9bQ5SVR0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tbc1d9bQ5SVR0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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