Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms