Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms