Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms