Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms