Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5aQ3UXZ9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5aQ3UXZ9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5aQ3UXZ9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5aQ3UXZ9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5aQ3UXZ9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5aQ3UXZ9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5aQ3UXZ9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5aQ3UXZ9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5aQ3UXZ9 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5aQ3UXZ9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms