Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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Gm27235Q3UW50 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Gm27235Q3UW50 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Gm27235Q3UW50 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Gm27235Q3UW50 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm27235Q3UW50 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm27235Q3UW50 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm27235Q3UW50 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm27235Q3UW50 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm27235Q3UW50 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm27235Q3UW50 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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