Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms