Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms