Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Znf48Q3US17 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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