Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR50

Vwa5b2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b2Q3UR50 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms