Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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