Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms