Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms