Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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