Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hhla1Q3TYV2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms