Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms