Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd11Q1RNF8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd11Q1RNF8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd11Q1RNF8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd11Q1RNF8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd11Q1RNF8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd11Q1RNF8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd11Q1RNF8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd11Q1RNF8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd11Q1RNF8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd11Q1RNF8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd11Q1RNF8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd11Q1RNF8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd11Q1RNF8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd11Q1RNF8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd11Q1RNF8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd11Q1RNF8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd11Q1RNF8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd11Q1RNF8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd11Q1RNF8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd11Q1RNF8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd11Q1RNF8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd11Q1RNF8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd11Q1RNF8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd11Q1RNF8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd11Q1RNF8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd11Q1RNF8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd11Q1RNF8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd11Q1RNF8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd11Q1RNF8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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