Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ptchd1Q14B62 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ptchd1Q14B62 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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ptchd1Q14B62 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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ptchd1Q14B62 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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ptchd1Q14B62 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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ptchd1Q14B62 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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