Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms