Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms