Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms