Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms