Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hspg2Q05793 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hspg2Q05793 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms