Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox10Q04888 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox10Q04888 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox10Q04888 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox10Q04888 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox10Q04888 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox10Q04888 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox10Q04888 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox10Q04888 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox10Q04888 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox10Q04888 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox10Q04888 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox10Q04888 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox10Q04888 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox10Q04888 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox10Q04888 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox10Q04888 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox10Q04888 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox10Q04888 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox10Q04888 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox10Q04888 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox10Q04888 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox10Q04888 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox10Q04888 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox10Q04888 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox10Q04888 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox10Q04888 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox10Q04888 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox10Q04888 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox10Q04888 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox10Q04888 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms