Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelaQ04207 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelaQ04207 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RelaQ04207 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RelaQ04207 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RelaQ04207 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RelaQ04207 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RelaQ04207 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RelaQ04207 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RelaQ04207 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms