Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2cQ01098 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms