Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms