Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms