Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gfra1P97785 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra1P97785 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms