Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx2P81066 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx2P81066 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx2P81066 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx2P81066 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx2P81066 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx2P81066 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx2P81066 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx2P81066 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx2P81066 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx2P81066 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms