Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms