Protein–RNA interactions for Protein: P63139

Nfyb, Nuclear transcription factor Y subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfybP63139 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfybP63139 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfybP63139 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfybP63139 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfybP63139 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfybP63139 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfybP63139 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfybP63139 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfybP63139 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfybP63139 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfybP63139 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NfybP63139 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfybP63139 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfybP63139 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfybP63139 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfybP63139 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfybP63139 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfybP63139 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfybP63139 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfybP63139 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NfybP63139 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NfybP63139 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NfybP63139 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NfybP63139 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfybP63139 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfybP63139 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NfybP63139 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfybP63139 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfybP63139 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfybP63139 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NfybP63139 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfybP63139 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfybP63139 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfybP63139 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfybP63139 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfybP63139 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfybP63139 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfybP63139 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfybP63139 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfybP63139 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfybP63139 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfybP63139 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfybP63139 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NfybP63139 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfybP63139 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfybP63139 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NfybP63139 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfybP63139 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfybP63139 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfybP63139 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfybP63139 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfybP63139 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfybP63139 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfybP63139 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfybP63139 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfybP63139 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfybP63139 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfybP63139 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfybP63139 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfybP63139 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfybP63139 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfybP63139 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NfybP63139 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NfybP63139 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfybP63139 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfybP63139 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfybP63139 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfybP63139 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfybP63139 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfybP63139 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfybP63139 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfybP63139 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfybP63139 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfybP63139 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfybP63139 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfybP63139 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfybP63139 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfybP63139 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfybP63139 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfybP63139 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfybP63139 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfybP63139 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfybP63139 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfybP63139 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfybP63139 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfybP63139 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfybP63139 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfybP63139 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfybP63139 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfybP63139 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfybP63139 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NfybP63139 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfybP63139 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfybP63139 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfybP63139 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfybP63139 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfybP63139 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfybP63139 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfybP63139 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfybP63139 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms